从应天保卫战到洪都归降，双方的军事力量仅仅在一年多的时间里就发生了很大的变化，由弱变强，朱元璋已经具备了和陈友谅一决雌雄的实力。1362年二月，朱元璋返回应天，他召集诸位将领研究下一步的战略，对东西两个敌对势力比较分析之后，他指出：“友谅剽而轻，其志骄。士诚狡而懦，其器小。志骄则好生事，器小则无远图。若攻士诚，友谅必空国而来，使我疲于应敌，事有难为。先取友谅，士诚必不能逾姑苏一步，以为之援。”
经过这几次的战争后，朱元璋强调：今后的战略仍是先攻陈友谅，后灭张士诚。
评析：
应天保卫战，在敌强我弱的形势下，朱元璋能寻找机会，抓住机遇，变被动为主动，精心设计并导演了这次战斗，充分显示了他驾驭战争的能力。这次战斗进行的每一步都在朱元璋的预料之中，初步显示了他的军事天赋。朱元璋抓住陈友谅骄傲轻敌的弱点，诱敌上钩；又借助应天地理形势复杂的有利条件，将陈友谅巨舰引入狭窄的河道；又巧妙准确地掌握江水涨潮退潮的时机，使之搁浅，逼敌军弃舟登岸。避开敌军善水战之长，发挥自己善陆战的优势，以少胜多，以弱胜强，使应天转危为安。
